L’Institut d’Ecologia Aquàtica (IEA) és un institut universitari de recerca creat l’any 1987 a la universitat de Girona i dedicat a l’estudi dels ecosistemes aquàtics continentals (llacs, rius, embassaments, aiguamolls, etc.) i marins. Actualment consta de tres seccions —limnologia, microbiologia i biologia marina—, corresponents a tres grups de recerca amb més 30 investigadors experts en l’àmbit.